Mycoplasma genitalium, één van de kleinste vrij levende bacteriën, bevat een relatief klein aantal enzymen, gezien zijn zeer beperkte genoom. Het exacte aantal enzymen in M. genitalium hangt af van hoeveel genen direct coderen voor enzymatische functies, maar er zijn schattingen gebaseerd op de analyse van zijn genoom.
Genoom van Mycoplasma genitalium
- Genoomgrootte: ongeveer 580.000 basenparen.
- Aantal genen: 525 genen in totaal.
- Codering voor eiwitten: Van deze genen coderen de meeste voor eiwitten, en een aanzienlijk deel daarvan zijn enzymen betrokken bij:
- Basale stofwisselingsprocessen (zoals glycolyse).
- DNA-replicatie en -herstel.
- Eiwitsynthese (ribosomaal).
Aantal Enzymen
Onderzoekers schatten dat ongeveer 100 tot 150 enzymen verantwoordelijk zijn voor de essentiële metabolische processen van M. genitalium. Dit is mogelijk gemaakt doordat de bacterie:
- Veel afhankelijk is van zijn gastheer voor voedingsstoffen en energie, wat een groot deel van de enzymen die andere organismen nodig hebben overbodig maakt.
- Alleen een kernset van enzymen bevat die nodig zijn voor:
- Energiewinning via fermentatie (het kan glucose omzetten in energie).
- Synthese van een paar essentiële bouwstenen, zoals aminozuren.
Bijzonderheden
- Metabolisch minimalisme: Omdat M. genitalium een intracellulaire parasiet is, heeft het geen complexe enzymatische systemen nodig voor bijvoorbeeld biosynthese van veel stoffen. Het haalt deze uit de gastheercel.
- Essentialome: Experimenten met gen-knockouts hebben aangetoond dat slechts ongeveer 300 van de 525 genen essentieel zijn voor overleving, waaronder die voor de productie van enzymen.
Conclusie: Mycoplasma genitalium bevat naar schatting tussen de 100 en 150 enzymen, wat relatief weinig is, maar voldoende om de basale functies van dit uiterst minimalistische organisme te ondersteunen.
Opmerking: verschillende bronnen wijken sterk af van mekaar, we gebruiken deze getallen als een minimum om van een 'levende' bacterie te kunnen spreken in een waarschijnlijkheidsberekening.